形状不同：吊瓜子的外形更加像西瓜籽,二者的大小形状都差不多,但是吊瓜子相对于西瓜籽更饱满、颜色也是更加灰暗,而且吊瓜子的两头还是开口的。瓜蒌子则是呈现扁平的椭圆形,瓜蒌子的种皮坚硬,内种皮膜质,而且瓜蒌子的表面呈棕褐色,沟纹更加明显且环边更加的宽,顶端呈平截状。
生长方式不同：吊瓜子和瓜蒌子来源于同一种植物的种子,从根本上说它们没有明显区别存在,因为它们都是葫芦科植物栝楼的种子,只是瓜蒌子是把这种植物种子收取以后晒干得到的中药奢,而吊瓜子则人们收取栝楼种子以后经过清洗和炒制以后得到的零食。
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